KAKUDA Nobuto
Faculty of Life and Medical Sciences Department of Medical Life Systems
Assistant Professor
Last Updated :2021/10/23

Researcher Profile and Settings

Research Interests

  • Amyloid beta protein
  • gamma-secretase
  • Alzheimer's disease

Research Areas

  • Life sciences/Neuropathology

Academic & Professional Experience

  • Faculty of Life and Medical Sciences Department of Medical Life Systems, Doshisha University, 2015/04 - Today
  • Postdoctral fellow, KU Leuven, 2013/09 - 2015/03
  • Researcher, Doshisha University Organization for Research Initiatives and Development, 2011/04 - 2013/08

Education

  • The University of Tokyo, 2005
  • The University of Tokyo, Graduate School, Division of Medical Sciences, 2005
  • Tokyo Institute of Technology, Bioscience and Biotechnology, 2001
  • Tokyo Institute of Technology, Graduate School, Division of Life Science and Engineering, 2001
  • Tokyo Institute of Technology, School of Bioscience and Biotechnology, 1999
  • Tokyo Institute of Technology, Faculty of Life Science and Engineering, 1999
  • National Institute of Technology, Nagaoka College
  • Nagaoka National College of Technology

Academic Degrees

  • Master of Engineering, Tokyo Institute of Technology

Published Papers

  • Visualization of Amyloid beta Deposits in Human Brain with Matrix-assisted Laser Desorption/Ionization Imaging Mass Spectrometry
    Ikegawa M, Nirasawa T, Kakuda N, Miyasaka T, Kuzuhara Y, Murayama S, Ihara Y
    Sep. 2018
  • Distinct deposition of amyloid-beta species in brains with Alzheimer's disease pathology visualized with MALDI imaging mass spectrometry
    Nobuto Kakuda, Tomohiro Miyasaka, Noriyuki Iwasaki, Takashi Nirasawa, Satoko Wada-Kakuda, Junko Takahashi-Fujigasaki, Shigeo Murayama, Yasuo Ihara, Masaya Ikegawa
    ACTA NEUROPATHOLOGICA COMMUNICATIONS, BIOMED CENTRAL LTD, 5(1)73 , Oct. 2017, English, Research paper (scientific journal)
  • Suspected limited efficacy of γ-secretase modulators
    Nobuto Kakuda, Kohei Akazawa, Hiroyuki Hatsuta, Shigeo Murayama, Yasuo Ihara
    Neurobiology of Aging, 34(4)1101 - 1104, Apr. 2013, English, Research paper (scientific journal)
  • Substrate ectodomain is critical for substrate preference and inhibition of γ-secretase
    Satoru Funamoto, Toru Sasaki, Seiko Ishihara, Mika Nobuhara, Masaki Nakano, Miho Watanabe-Takahashi, Takashi Saito, Nobuto Kakuda, Tomohiro Miyasaka, Kiyotaka Nishikawa, Takaomi C. Saido, Yasuo Ihara
    Nature Communications, 42529 , 2013, English, Research paper (scientific journal)
  • Altered ?-secretase activity in mild cognitive impairment and Alzheimer's disease
    Nobuto Kakuda, Mikio Shoji, Hiroyuki Arai, Katsutoshi Furukawa, Takeshi Ikeuchi, Kohei Akazawa, Mako Takami, Hiroyuki Hatsuta, Shigeo Murayama, Yasuhiro Hashimoto, Masakazu Miyajima, Hajime Arai, Yu Nagashima, Haruyasu Yamaguchi, Ryozo Kuwano, Kazuhiro Nagaike, Yasuo Ihara
    EMBO MOLECULAR MEDICINE, WILEY-BLACKWELL, 4(4)344 - 352, Apr. 2012, English, Research paper (scientific journal)
  • Tannic Acid Is a Natural beta-Secretase Inhibitor That Prevents Cognitive Impairment and Mitigates Alzheimer-like Pathology in Transgenic Mice
    Takashi Mori, Kavon Rezai-Zadeh, Naoki Koyama, Gary W. Arendash, Haruyasu Yamaguchi, Nobuto Kakuda, Yuko Horikoshi-Sakuraba, Jun Tan, Terrence Town
    JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY, AMER SOC BIOCHEMISTRY MOLECULAR BIOLOGY INC, 287(9)6912 - 6927, Feb. 2012, English, Research paper (scientific journal)
  • [Amyloid beta protein of CSF].
    Kakuda N, Ihara Y
    Nihon rinsho. Japanese journal of clinical medicine, 69 Suppl 8542 - 545, Oct. 2011
  • A potential defense mechanism against amyloid deposition in cerebellum.
    Alam Shahnur, Masaki Nakano, Seiko Ishihara, Nobuto Kakuda, Tomohiro Miyasaka, Hina Uchiyama, Yuuna Shirai, Mohammad Moniruzzaman, Takashi Saito, Takaomi C Saido, Masaki Nishimura, Satoru Funamoto
    Biochemical and biophysical research communications, 53525 - 32, 08 Jan. 2021, English, Research paper (scientific journal)
  • γ-Secretase Activity Is Associated with Braak Senile Plaque Stages.
    Nobuto Kakuda, Haruyasu Yamaguchi, Kohei Akazawa, Saori Hata, Toshiharu Suzuki, Hiroyuki Hatsuta, Shigeo Murayama, Satoru Funamoto, Yasuo Ihara
    The American journal of pathology, 190(6)1323 - 1331, Jun. 2020, English, Research paper (scientific journal)
  • Chronological Profiling of Plasma Native Peptides after Hepatectomy in Pigs: Toward the Discovery of Human Biomarkers for Liver Regeneration
    Kohta Iguchi, Etsuro Hatano, Takashi Nirasawa, Noriyuki Iwasaki, Motohiko Sato, Gen Yamamoto, Kenya Yamanaka, Tatsuya Okamoto, Yosuke Kasai, Naohiko Nakamura, Hiroaki Fuji, Tomohito Sakai, Nobuto Kakuda, Satoru Seto, Kojiro Taura, Kei Tashiro, Shinji Uemoto, Masaya Ikegawam
    PLOS ONE, PUBLIC LIBRARY SCIENCE, 12(1)e0167647 , Jan. 2017, English, Research paper (scientific journal)
  • Equimolar production of amyloid beta-protein and amyloid precursor protein intracellular domain from beta-carboxyl-terminal fragment by beta-secretase
    N Kakuda, S Funamoto, S Yagishita, M Takami, S Osawa, N Dohmae, Y Ihara
    JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY, AMER SOC BIOCHEMISTRY MOLECULAR BIOLOGY INC, 281(21)14776 - 14786, May 2006, English, Research paper (scientific journal)
  • Transcriptional analysis of the ostA/imp gene involved in organic solvent sensitivity in Escherichia coli
    Ohtsu, I, N Kakuda, N Tsukagoshi, N Dokyu, H Takagi, M Wachi, R Aono
    BIOSCIENCE BIOTECHNOLOGY AND BIOCHEMISTRY, TAYLOR & FRANCIS LTD, 68(2)458 - 461, Feb. 2004, English, Research paper (scientific journal)
  • Potential link between amyloid beta-protein 42 and C-terminal fragment gamma 49-99 of beta-amyloid precursor protein
    T Sato, N Dohmae, Y Qi, N Kakuda, H Misonoum, R Mitsumori, H Maruyama, EH Koo, C Haass, K Takio, M Morishima-Kawashima, S Ishiura, Y Ihara
    JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY, AMER SOC BIOCHEMISTRY MOLECULAR BIOLOGY INC, 278(27)24294 - 24301, Jul. 2003, English, Research paper (scientific journal)
  • n-hexane sensitivity of Escherichia coli due to low expression of imp/ostA encoding an 87 kDa minor protein associated with the outer membrane
    S Abe, T Okutsu, H Nakajima, N Kakuda, W Ohtsu, R Aono
    MICROBIOLOGY-SGM, SOC GENERAL MICROBIOLOGY, 149(Pt 5)1265 - 1273, May 2003, English, Research paper (scientific journal)

Misc

  • 腎アミロイドーシスのホルマリン固定試料を対象としたイメージング質量分析法と液体クロマトグラフィータンデム型質量分析法を統合したプロテオミクス・ワークフローの確立
    武笠結天, 葛原由貴, 寺田恵, 韮澤崇, RABANT Marion, DUONG VAN, HUYEN Jean‐Paul, BRUNEVAL Patrick, 植田初江, 角田伸人, 池川雅哉
    JSBMS Letters, 44(3)51 , 25 Nov. 2019, Japanese
  • イメージング質量分析法を用いた拡張型心筋症ハムスターモデルのin depth組織プロテオーム解析
    新谷祈, 辻崇, 石田瑞希, 韮澤崇, 角田伸人, 植田初江, 升本英利, 湊谷謙司, 池川雅哉
    JSBMS Letters, 44(3)50‐51 , 25 Nov. 2019, Japanese
  • イメージング質量分析法を用いた薬理量リチウム(Li)の脳内分布の解析
    安井悠生, 山本康太, 亀山大樹, 角田伸人, 平田岳史, 池川雅哉
    JSBMS Letters, 44(Supplement)132 , 25 Aug. 2019, Japanese
  • MALDIイメージング質量分析法とショットガンプロテオミクス法を用いたパラフィン包埋腎生検組織の高深度プロテオーム解析
    武笠結天, 梶田遼, 韮澤崇, RABANT Marion, DUONG VAN, HUYEN Jean‐Paul, BRUNEVAL Patrick, 植田初江, 角田伸人, 池川雅哉
    JSBMS Letters, 44(Supplement)125 , 25 Aug. 2019, Japanese
  • 全身イメージング質量分析法を用いたマウス母乳成分の消化・吸収・代謝プロセスの可視化
    小関将人, 辻雄大, 山本卓志, 山口真一, 藤分秀司, 中邨智之, 角田伸人, 谷史人, 池川雅哉
    JSBMS Letters, 44(Supplement)130 , 25 Aug. 2019, Japanese
  • MALDI‐イメージング質量分析法を用いた多発性硬化症のプロテオミクスレベルのバイオマーカーと治療標的の特定
    田中那美, 山下浩輝, 韮澤崇, 梶田遼, 田口勝敏, 田中雅樹, 近藤誉之, 辻雄大, 角田伸人, 池川雅哉
    質量分析総合討論会講演要旨集, 67th149 , 26 Apr. 2019, Japanese
  • MALDI‐イメージング質量分析法を用いた実験的自己免疫性脳脊髄炎マウス中枢神経系組織プロテオーム解析による多発性硬化症のバイオマーカーと治療標的の特定
    田中那美, 山下浩輝, 韮澤崇, 梶田遼, 田口勝敏, 田中雅樹, 近藤誉之, 辻雄大, 角田伸人, 池川雅哉
    質量分析総合討論会講演要旨集, 67th133 , 26 Apr. 2019, Japanese
  • MALDI‐イメージング質量分析法とショットガンプロテオミクスを用いた拡張型心筋症モデルJ2N‐kハムスターの病態解析
    新谷祈, 辻崇, 石田瑞希, 韮澤崇, 角田伸人, 植田初江, 升本英利, 湊谷謙司, 池川雅哉
    質量分析総合討論会講演要旨集, 67th204 , 26 Apr. 2019, Japanese
  • W突然変異マウスのWhisker毛包における組織プロテオーム解析
    小杉茉由佳, 木下和生, 韮澤崇, 梶田遼, 角田伸人, 池川雅哉
    質量分析総合討論会講演要旨集, 67th62 , 26 Apr. 2019, Japanese
  • Imaging Mass Spectrometry to Study Neuropathology of Alzheimer's Disease
    池川 雅哉, 角田 伸人, 宮坂 知宏, 韮澤 崇, 村山 繁雄, 井原 康夫
    臨床病理 = The official journal of Japanese Society of Laboratory Medicine : 日本臨床検査医学会誌, 日本臨床検査医学会 ; 1953-, 66(9)1004 - 1009, Sep. 2018, Japanese
  • 薬剤性嗅覚障害モデルマウスにおけるメタボローム解析を用いた生体内代謝変動について
    友野卓哉, 亀山大樹, 山本卓志, 藤分秀司, 角田伸人, 中邨智之, 池川雅哉
    JSBMS Letters, 43(Supplement)85 , 25 Aug. 2018, Japanese
  • イメージングマススペクトロメトリー法を用いたホルマリン固定パラフィン包埋バイオプシー試料から腎アミロイドーシスの鑑別診断
    武笠結天, 葛原由貴, 寺田恵, 韮澤崇, RABANT Marion, VAN HUYEN Jean‐Paul Duong, BRUNEVAL Patrick, 植田初江, 角田伸人, 池川雅哉
    JSBMS Letters, 43(Supplement)131 , 25 Aug. 2018, Japanese
  • イメージング質量分析法を用いたアミロイドーシスの高深度プロテオミクス
    池川雅哉, 角田伸人, 韮澤崇, 植田初江
    JSBMS Letters, 43(Supplement)39 , 25 Aug. 2018, Japanese
  • レーザーアブレーションICP‐MSを用いた薬理量リチウムの脳内分布の可視化
    安井悠生, 亀山大樹, 塚本傭平, 黒木康夫, 本多和人, 角田伸人, 池川雅哉
    JSBMS Letters, 43(Supplement)116 , 25 Aug. 2018, Japanese
  • イメージング質量分析法を用いた実験的自己免疫性脳脊髄炎マウスモデルの脳・脊髄解析から多発性硬化症のバイオマーカーと治療標的の発見
    田中那美, 山下浩輝, 韮澤崇, 田口勝敏, 田中雅樹, 近藤誉之, 辻雄大, 角田伸人, 池川雅哉
    JSBMS Letters, 43(Supplement)133 , 25 Aug. 2018, Japanese
  • 糖尿病性腎症モデルラット腎臓のMALDIイメージング質量分析法を用いたIn Situプロテオーム解析法の確立
    葛原由貴, 武笠結天, 韮澤崇, 植田初江, 角田伸人, 池川雅哉, 池川雅哉
    JSBMS Letters, 43(Supplement)134 , 25 Aug. 2018, Japanese
  • イメージング質量分析法を用いたアルツハイマー病脳病理研究
    池川雅哉, 角田伸人, 宮坂知宏, 韮澤崇, 藤ヶ崎純子, 村山繁雄, 井原康夫
    臨床病理, 65073 , 20 Oct. 2017, Japanese
  • イメージング質量分析法を用いた実験的自己免疫性脳脊髄炎(EAE)マウス脳・脊髄の組織病理学的プロテオーム・プロファイリング
    山下浩輝, 韮澤崇, 工藤寿治, 田口勝敏, 田中雅樹, 近藤誉之, 角田伸人, 池川雅哉
    質量分析総合討論会講演要旨集, 65th131 , 01 May 2017, Japanese
  • 心血管疾患病理解析のためのイメージング質量分析法
    韮澤崇, 難波寛子, 寺田恵, 工藤寿治, 宮坂知宏, 角田伸人, BRUNEVAL P, 植田初江, 池川雅哉
    質量分析総合討論会講演要旨集, 65th222 , 01 May 2017, Japanese
  • イメージング質量分析法を用いた肝臓内ATP可視化におけるheat stabilizationの有用性に関する検討
    井口公太, 辻雄大, 中川祐輝, 杉浦悠毅, 中邨智之, 角田伸人, 池川雅哉, 上本伸二
    質量分析総合討論会講演要旨集, 65th55 , 01 May 2017, Japanese
  • イメージング質量分析法を用いたアルツハイマー病脳タンパク質の解析
    池川雅哉, 宮坂知宏, 角田伸人, 岩崎了教, 韮澤崇, 藤ヶ崎純子, 村山繁雄, 井原康夫
    Dementia Japan, 30(4)562 , 15 Oct. 2016, Japanese
  • Imaging Mass Spectrometry for the Research of Alzheimer's Disease
    IKEGAWA Masaya, MIYASAKA Tomohiro, KAKUDA Nobuto, IHARA Yasuo
    Journal of the Mass Spectrometry Society of Japan, The Mass Spectrometry Society of Japan, 64(1)17 - 20, 2016, Japanese
  • イメージングマススペクトロメトリーを用いたアルツハイマー病脳の解析
    池川雅哉, 宮坂知宏, 角田伸人, 岩崎了教, 韮澤崇, 隅蔵大幸, 村山繁雄, 井原康夫, 井原康夫
    Dementia Japan, 29(3)376 , 15 Sep. 2015, Japanese
  • アルツハイマー病脳研究のための質量イメージング解析
    池川雅哉, 宮坂知宏, 角田伸人, 岩崎了教, 韮澤崇, 隅蔵大幸, 村山繁雄, 井原康夫
    JSBMS Letters, 40(Supplement)40 , 20 Aug. 2015, Japanese
  • げっ歯類精巣におけるヌクレオチドのイメージング質量分析
    中西勝之, 辻雄大, 中川祐輝, 井口公太, 角田伸人, 中邨智之, 松井喜之, 市岡健太郎, 小川修, 池川雅哉
    JSBMS Letters, 40(Supplement)107 , 20 Aug. 2015, Japanese
  • イメージング質量分析を用いたアルツハイマー病脳の解析
    池川雅哉, 宮坂知宏, 角田伸人, 岩崎了教, 韮澤崇, 隅蔵大幸, 村山繁雄, 井原康夫
    質量分析総合討論会講演要旨集, 63rd99 , 08 Jun. 2015, Japanese
  • MCIおよびAD脳ではγ-secretase活性は変化している?!
    角田 伸人, 東海林 幹夫, 荒井 啓行, 古川 勝敏, 桑野 良三, 池内 健, 赤澤 宏平, 山口 晴保, 村山 繁雄, 長島 優, 長池 一博, 井原 康夫
    Dementia Japan, (一社)日本認知症学会, 24(3)309 - 309, Sep. 2010, Japanese
  • Relationship between gamma- and epsilon-cleavage of APP
    Y Ihara, T Sato, N Dohmae, Y Qi, N Kakuda, M Morishima-Kawashima, S Ishiura, C Haas
    JOURNAL OF NEUROCHEMISTRY, BLACKWELL PUBLISHING LTD, 8739 - 39, Dec. 2003, English, Research paper, summary (international conference)